W postępowaniu kwalifikacyjnym brane są pod uwagę następujące przedmioty (dwa lub jeden), biologia, chemia, fizyka, informatyka, matematyka na poziomie podstawowym albo rozszerzonym.

Kandydaci ze Starą Maturą przystępują do Centralnych Egzaminów Wstępnych przygotowanych w porozumieniu z Centralną Komisję Egzaminacyjną z dwóch (lub jednego, tak samo jak u nowych maturzystów) spośród następujących przedmiotów, biologia, chemia, fizyka, matematyka na poziomie podstawowym lub rozszerzonym.

Na podstawie postępowania kwalifikacyjnego na studia pierwszego stopnia tworzy się listę rankingową dla wszystkich kandydatów na daną specjalność (patrz FAQ). W pierwszej kolejności przyjmowani są kandydaci, którzy uzyskali najwyższą liczbę punktów możliwych do zdobycia w postępowaniu kwalifikacyjnym. Pozostali kandydaci zajmują kolejne miejsca na liście rankingowej (w ramach limitu miejsc) według malejącej liczby punktów konkursowych PK.

Kwalifikacja na specjalności Biofizyka molekularna oraz Projektowanie molekularne i bioinformatyka prowadzona jest wspólnie. Ostateczna kwalifikacja na specjalności Biofizyka molekularna oraz Projektowanie molekularne i bioinformatyka odbędzie się po II roku studiów spośród kandydatów, którzy zaliczyli pierwsze dwa lata studiów według programu wspólnego dla tych dwóch specjalności. Na podstawie zsumowanych ocen z I i II roku studiów (z wyłączeniem oceny z wychowania fizycznego) tworzy się listę rankingową dla wszystkich kandydatów. Każdy z kandydatów podaje wówczas wybieraną specjalność Biofizyka molekularna lub Projektowanie molekularne i bioinformatyka. Miejsca na każdej z tych specjalności przydzielane są kolejno do wyczerpania miejsc wg pozycji kandydata na liście rankingowej. Kandydaci, dla których zabraknie miejsc na wybranej specjalności kierowani są na drugą specjalność.

Kandydaci zakwalifikowani na studia zobowiązani są do złożenia oryginału lub odpisu świadectwa maturalnego albo świadectwa dojrzałości oraz wszystkich innych wymaganych dokumentów w podanym przez Komisję Rekrutacyjną terminie. Kandydaci z dalszych pozycji będą kwalifikowani na studia w miarę zwalniania się miejsc na liście rankingowej. Osoby, które w wyznaczonym przez Wydziałową Komisję Rekrutacyjną terminie nie dostarczą wymaganych dokumentów zostaną skreślone z listy rankingowej.